Koronavirus

[Toope]

Tämä ainakin uutta tietoa, suomeksi 

https://www.mtvuutiset.fi/artikkeli/tutkijoilta-huolestuttava-loyto-koronaviruksesta-havaittiin-uusi-mutatoitunut-kanta-vaikuttaa-alkuperaista-tartuttavammalta/7811798#gs.60d8c5

Kantsiiko noita kouluja avata ihan vielä?

[MrKAT]

^^"uusi mutaatio.. vaikuttaa tartuttavammalta.."  on ilmeisesti (taas) uutisankka. Ja nyt myös itse tiedeartikkelissa.
Sen on tyrmänneet jo eilen virologit joiden twiittejä seuraan. Esim. Dr. Angela Rasmussen 5. toukokuuta:

This type of reporting on #SARSCoV2 #COVID19 #coronavirus makes my blood boil. There is no evidence that the dominant strain is such because it is "more contagious"
  A mutant coronavirus has emerged, even more contagious than the original ...
   - Latimes.com
-
It's based on this pre-print, which is strictly a computational analysis of virus sequences. They found a mutation that became dominant over time but didn't do anything to show its functional significance in transmission.
-
The old adage that correlation does not equal causation applies here. If you are looking at sequence data alone, you can't show effect that this single mutation, spike D614G has on transmission. This means that a mutation at position 614 in spike changed aspartic acid to glycine
. . .
The title of the preprint is very misleading. "Spike mutation pipeline reveals the emergence of a more transmissible form of SARS-CoV-2"...NO it does not. It reveals the emergence of a substitution of aspartic acid for glycine at position 614.
. . .
These conclusions about increased transmissibility based on correlation analyses are an overreach. We don't know if the virus is "more transmissible." Experimental evidence or it didn't happen.
  - https://twitter.com/angie_rasmussen/status/1257716419166236672

Lisäksi Brian Wasik, Tara c Smith jne joiden arvio tutkimuksesta on lyhyesti: "study is poor" -> google translator:"Tutkimus on huono".

[MrKAT]

Em. Brian Wasik nosti esiin evoluutiotapahtuman nimeltä genetic drift (geneettinen ajautuminen) jossa tapahtuu "alleelifrekvenssien muuttumista sukupolvesta toiseen pelkästään lisääntymisprosessiin liittyvän geenien siirtymisen sattumanvaraisuuden takia." -  https://fi.wikipedia.org/wiki/Geneettinen_ajautuminen.
Siten ao. kuvassa sinisistä tulee dominoiva "mutantti" puhtaasti sattuman eikä tartuttavuuden tai muun evoluutio-edun takia:

- https://en.wikipedia.org/wiki/Genetic_drift#Analogy_with_marbles_in_a_jar

[Jaska]

Tämä ainakin uutta tietoa, suomeksi 

https://www.mtvuutiset.fi/artikkeli/tutkijoilta-huolestuttava-loyto-koronaviruksesta-havaittiin-uusi-mutatoitunut-kanta-vaikuttaa-alkuperaista-tartuttavammalta/7811798#gs.60d8c5

Maikkarin juttu on sama uutinen, jonka Norma juuri edellä antoi MSN:n kautta suomeksi jaeltuna. Mielestäni olen lukenut koronan uusista kannoista suomeksikin jo ajat sitten. Tätä jenkkien tutkimustulosta muutoksista joita olisi perustetta nimittää uudeksi viruskannaksi näyttävät asiantuntijat pitävän kiistanalaisena kuten pari kuukautta sitten julkisuuteen päästettyä kiinalaistenkin tuloksia samasta asiasta. Sitä ei ole kiistetty, etteikö koronaviruksen perimässä tapahtuisi muutoksia. Itse asiassa nämä tutkimukset kuuluvat siihen selvitystyöhön, jossa koronaviruksesta hankitaan tietoa. Kritiikki kohdistuu siihen, onko muutoksia pidettävä vain tavanmaisina virusmuutoksina sekä siihen onko tutkimus tehty kunnolla ja luotettavasti. Maallikkona ajatteleisin, että on arvokasta, jos on saatu tietoa taudin muuttumisesta. Ilmankin sen käyttäytyminen näyttää olevan moninaista.

WHO on ottanut kannan, että Etelä-Koreassa raportoidut tapaukset, että covid-19-taudin sairastaneilta on löydetty testeissä SARS-CoV-2 virusta, eivät ole uudelleentartuntoja vaan virukset ovat peräisin aikaisemmasta sairastamisjaksosta, todennäköisimmin kuolleita viruksia. Siinä käsityksessä olen, että vakavana sairastetun taudin kuvaan myös usein kuuluu paremman ja huonomman tilan aaltoilu.

Aiemminkin olen tässä ketjussa kiinnittänyt huomiota pieneen toipuneiksi kirjattujen määrään. 3,8 miljoonasta vahvistetusta tartunnasta vain 1,3 miljoonaa on kirjattu parantuneiksi ja 2,3 miljoonaa sairastaa akuutisti. Kuolleita on tähän mennessä 264 000.
Vahvistetuista tartunnoista 1,5 miljoonaa on Euroopassa (mukaanlukien koko Venäjä, jossa kasvu on USAn tapaan huikeaa), 1,4 miljoonaa Pohjois-Amerikassa, 0,6 miljoonaa Aasiassa, 0,3 miljoonaa Etelä-Amerikassa, 0,05 miljoonaa Afrikassa ja 0,008 miljoonaa Oseaniassa.

[Jaska]

Tässä pari viikkoa vanha suomalaisten asiantuntijoiden hyvä näkemys, mitä koronaviruksesta tiedetään

https://yle.fi/uutiset/3-11307734

Paljon liikkuu spekulaatiota ja virheellistä tietoa. Kannattaa opetella tunnistamaan luotettava tieto.

[Norma Bates]

Minäkin luin jo ajat sitten että koronaviruksesta A on mutatoitunut muoto B ja B:stä C. Missään vaiheessa en ole lukenut mistään että myöhäisemmät muodot olisivat sen tartuttavampia. Olisiko lie sitten tuon MSN:n uutinen ollut osittain vanha (mutaatioita tapahtunut) ja osittain valheellinen (mutaatio vaarallisempi). Ihmettelen että minkä takia älypuhelimeni Google sitten tarjoilee tällaisia uutisia, jos kerta niissä ei ole ns. villoja.

[Karikko]

Minäkin luin jo ajat sitten että koronaviruksesta A on mutatoitunut muoto B ja B:stä C. Missään vaiheessa en ole lukenut mistään että myöhäisemmät muodot olisivat sen tartuttavampia. Olisiko lie sitten tuon MSN:n uutinen ollut osittain vanha (mutaatioita tapahtunut) ja osittain valheellinen (mutaatio vaarallisempi). Ihmettelen että minkä takia älypuhelimeni Google sitten tarjoilee tällaisia uutisia, jos kerta niissä ei ole ns. villoja.

No jos villoista puhutaan, niin kaikki uutiset ovat googlelle villoja ja niiden välittäminen sekä mainostajien saaminen tietää herra googlelle "villoja".


Uutista ja uutisia pitää lukea sillä silmällä ja korvalla, että vastuu on lukijalla.

Eli ihan sama, kuin politikkoja ja muita senkaltaisia kuunnellessa.

Tämä rokotusjuttukin vaikuttaa vanhalta keksinnölä, kuten immuniteetin saamiselta luontaisesti- pienellä avustuksella.

Mutta ehkä hyvä uutinen-

IL-

Suomessa on käynnissä kehityshanke, jossa koronaa vastaan suunnitellaan poikkeuksellista nenän kautta suihkeena annettavaa rokotetta. Perinteisissä rokotteissa kehoon ruiskutetaan yleensä vaarattomiksi tehtyjä viruksia, jotka saavat kehon tuottamaan vasta-aineita.

Sensuroimaton Päivärinta -ohjelmassa vieraillut Helsingin yliopiston virologian professori Kalle Saksela kertoi uudesta hankkeesta.

– Tässä käytetään adenovirukseen perustuvaa geenikuljetinta, joka matkii adenoviruksen varhaisia vaiheita, mutta viekin koronaviruksen piikkiproteiinia tuottavan geenin rokotettavan soluihin eli tässä tapauksessa nenän limakalvoille. Se sitten aikansa tuottaa siellä rokotetta ja immuunivaste syntyy. Tämän takia sitä rokotetta ei tarvitse tuottaa jossain bioreaktorissa, joka on aikaa vievää ja hankalaa, vaan rokotetut henkilöt ikään kuin itse toimivat rokotetehtaina.

Katso yltä haastattelu, missä hän kertoo, että rokote olisi tarvittaessa saatavissa käyttöön huomattavasti nopeammin kuin mitä viralliset ennusteet ovat kertoneet.

Alla koko haastattelu, jossa Saksela kertoo myös, että maailmalla on jo valmiina rokote, jonka pitäisi olla turvallinen ja tehoka

[Norma Bates]

https://tekniikanmaailma.fi/tutkijat-loysivat-koronaviruksesta-uuden-mutaation-joka-muistuttaa-vuoden-2003-sars-epidemian-deleetio-mulaatiota/

Arizonan osavaltionyliopiston tutkimusryhmä on löytänyt uudesta koronaviruksesta mutaation, jota ei ole löydetty aiemmin. Mutaatiossa 81 nukleotidia on pysyvästi kadonnut viruksen perimästä.

Arizonan osavaltionyliopiston tutkijat lukevat SARS-CoV-2-viruksen perintöaineksen uudella, nopealla teknologialla, niin sanotulla uuden sukupolven sekvensoinnilla. He pyrkivät selvittämään, miten virus saattaa levitä, mutatoitua ja sopeutua ajan kuluessa.

Ryhmä käytti tutkimuksessaan 382 nenänäytteen poolia. Näytteet oli otettu mahdollisilta koronavirustapauksilta Arizonassa.

Tutkimus on julkaistu maanantaina Journal of Virology -lehden verkkoversiossa.

UUDEN KORONAVIRUKSEN genomia eli perintöainesta tutkitaan nyt monessa maassa.

Kaikki geenisekvenssitiedot talletetaan maailmanlaajuiseen tietokantaan, jota pitää yllä voittoa tavoittelematon tieteellinen organisaatio GISAID. Tähän mennessä on sekvensoitu 16 000 SARS-CoV-2-genomia, mikä on alle 0,5 prosenttia maailmalla kiertävistä kannoista.

Sekvenssitiedoista on selvinnyt, että SARS-CoV-2-virus on peräisin yhdestä ainoasta lähteestä Wuhanista Kiinasta, kun taas monet ensimmäisistä analysoiduista arizonalaistapauksista näyttävät tulleen todennäköisimmin Euroopasta.

NYT TEHTY MUTAATIOLÖYDÖS on tutkimusta johtaneen Efrem Limin mukaan herättänyt jo huomiota tiedeyhteisön keskuudessa.

"Yksi syy tämän mutaation kiinnostavuuteen on se, että se muistuttaa suurta, vuoden 2003 SARS-virusepidemian aikana syntynyttä deleetio-mutaatiota", Lim sanoo yliopiston tiedotteessa.

SARS-epidemian keski- ja myöhäisvaiheissa virukseen kertyi mutaatioita, jotka heikensivät virusta. Tutkijat uskovat, että heikentynyt virus, joka aiheuttaa vähemmän vakavan taudin, voi olla viruksen kannalta etu luonnonvalinnan eloonjäämiskamppailussa: vähemmän vakava tauti voi levitä tehokkaammin väestössä, koska sitä levittävät ihmiset eivät edes tiedä, että heillä on tartunta.

Nyt riehuva uusi koronavirus SARS-CoV-2 on aiemman SARS-viruksen geneettinen sukulainen.

MUTAATIO SAATTAISI myös osaltaan auttaa selvittämään, miten virus sairastuttaa ihmisen. On mahdollista, että siitä voi olla hyötyä tutkijoille, jotka kehittävät viruslääkkeitä tai rokotteita.

Jotta mutaation merkitys viruksen toiminnalle voidaan selvittää, tarvitaan kuitenkin lisätutkimuksia. Arizonalaisryhmä on jo aiheen kimpussa.

Päivämäärä 5.5.2020 ja kaiketi uutiseen voinee luottaa että on oikeasti tuore.

[Laika]

SARS-epidemian keski- ja myöhäisvaiheissa virukseen kertyi mutaatioita, jotka heikensivät virusta. Tutkijat uskovat, että heikentynyt virus, joka aiheuttaa vähemmän vakavan taudin, voi olla viruksen kannalta etu luonnonvalinnan eloonjäämiskamppailussa: vähemmän vakava tauti voi levitä tehokkaammin väestössä, koska sitä levittävät ihmiset eivät edes tiedä, että heillä on tartunta.

Juuri tuota pyrin vastauksessani Juhalle sanomaan. Vaikka periaatteessa tappavammat mutaatiotkin ovat mahdollisia, ihmiset ymmärtävät herkästi luonnonvalinnan nurinkurin. Viruksen kannalta katsottuna sen ei kannata tappaa isäntäeliötään, koska se tarvitsee isäntää proteiinintuotannossa. Siten valinta suosii niitä muotoja, jotka pystyvät prosessiin vähemmin vaurioin.

Mikään automaatti ei luonnonvalinta tietenkään ole, mutta ajatellaanpa tavallista kausi-influenssaa. Sen erilaiset variantit ovat kulkeneet väestön keskuudessa iät ajat, ja sikäli kuin siitä on kehittynyt nopeasti tappavia mutaatioita väestölle, en ole sellaisista ainakaan koskaan kuullut.

Huono uutinen on, että jotkin sairaudet ovat tunnettuja vuosien piinasta isäntäeliölleen. Esimerkiksi tuberkuloosi aikoinaan -ja maissa, joissa se on saanut resistenttejä muotoja, nykyään- saattoi vaivata ihmisiä vuosia, ja puhjeta tappavaan muotoonsa vasta vähitellen.

[Karikko]

^
Virus ehkä mutatoituu melko nopeasti, kun se on kuitenkin vieraassa ympäristössä ja ihmisolu voi olla hankalampi yhteisö sen eli-iän odotukselle.

Se varmaan sopeuttaa itseään uuteen isäntään ja siitä ehkä muodostuu lievempi  mutaatio.
Tuskin kuitenkaan suostuu enää koskaan poistumaan ihmisen seurasta, vaikka taitavat jotkut persutkin vaatia viruksen torppaamista "suomesta"  se lienee kyllä aika mahdoton tehtävä.

[Juha]

Peloite ei tepsi. Tarvitaan peloitteisempaa. Nämä ovat paljon säädöllisiä juttuja. Pientä päivitystystä jos saa virusmaaiman kautta, niin ihan jees.

Vaikka olisi vanhempi, niin tällaiset voivat rohkaista. Onko mahdollista?

Se tosiaan, että voidaan suoremmin käsitellä vaikka lääketiedettä, ja määräävin peruste on muuta. Eikö tämä usein ole se juttu? Sitä toisaalta hitokseen painotetaan, jos suoraan sopivaa.

[Juha]

Tiedon lisääminen, voi tuoda perusteita koronaan liittyvässä eri lailla, riippuen tahosta. Tiettyä tahoa koskevia intressejä voi hoidella paremmin, toisin sanoen kireyttä vähenee, jos tätä avaavaa on monenlaisena.

Miten eri tahojen liikkumatilan lisääntyminen, sitten käytetään solmujen löysyttämiseen, ja poistamiseen, eri asia. Yleensä tila viedään, sitä mukaa kun sitä syntyy. Juttu on yleismaailmallisemmin vaikuttava, ja toisaalta tapaus kytkeytyy osaksi sitä.

Millä tavoin koronakytköksen käyttöä voi arvioida? Onko tässä joitain erilaisia tahoja niin, ettei kaikki olisikaan ihan samassa paatissa?

Tieto on valtaa, ja mitä enemmän tiedolla ruokitaan, sen vahvemmin asiat saa sidottua, miten nyt vaikuttaakin. Ehkä tämä kannattaa ottaa kollektiivisena inventaariotapahtumana. Itse ainakin näen tällaisen mahdollisuuden, kun kerran kokoonnutaan näiden ääreen, tällä painolla. Media tienaa tietysti sivussa ihan kivasti.

Että puhutaan tosiaan lähelle menevästä, ja vaikka ohi koronan, vaikka isosti riskiryhmään kuuluva, niin ihmisenä olemista ajatellen, pääasia on käsittelyssä. Eikö ole hyvä?

[Juuli]

Mikään ei takaa etteikö kesällä sairastettu tauti jättäisi heikkoon kuntoon joka jatkuu syksyyn asti. Kuudenkin viikon sairastamisista on puhuttu aikuisten kohdalla, ja millään helkkarin ilveellä tartuntoja ei saada rajattua yksinomaan nuorisoon, ellei näitä sitten internoida joillekin sairastamisleireille kesän ajaksi.

30 asteen helteessä vähäoireinenkaan tauti tuskin on rattoisa sairastettava, jos sattuu himohelteet. Itsestäni tuntui jo kesällä 2018 että pumppu prakaa, ja se helle tod.näk. aiheutti fibromyalgian puhkeamisenkin.

Mutta jos suomalaiset perinteisesti lurkkivat kesän mökeillään, niin voi olla ettei tartunnat nuorisonkaan kesken leviä. Paitsi jos hakeutuvat jengeiksi kaupunkeihin. Koulut olisi pitänyt pitää kokoajan auki jos vapaata tartuttavuutta pitää käypänä ratkaisuna.

Just niin. Mikä ihmeen väläys oli avata koulut 2 viikoksi. Toiset joutuvat istuksimaan jumppasaleissa ym ruokaloissa olen kuullut. Kun on todistuksetkin vai mitkä ne nykyään on kirjoitettu jo ennemmin.
.

[Jaska]

Satunnaisia lukuja

Suomessa koronavirustautiin sairastuneeksi on vahvistettu yksi tuhannesta. Testejä on tehty 20 testiä  tuhatta asukasta kohti. Koronaan sairastuttuaan kuollut on 0,045 tuhannesta.

Tämän päivän tartunnoissa valtioitten kärkisijaa pitää Venäjä (146 milj.asukasta) 11000 uudella vahvistetulla tartunnalla, joka on enemmän kuin eilen. Menettänee ykköspaikan USAlle (331 milj. asukasta) jolla eilen oli 25000 uutta tartuntaa, Ja saattaa ohi mennä myös Brasilia (213 milj. asukasta), joka eilen ilmoitti 12000 uutta tartuntaa. Seuraavana uusien tartuntojen määrässä kulkee nyt Yhdistynyt Kuningaskunta (68 milj. asukasta) joka eilen ilmoitti 6000 uutta tartuntaa.

Testien määrässä suhteessa asukaslukuun USA on noussut järjestyssijalle 40 ja Suomi pudonnut sijalle 47.

[Juha]

Trump käy aika näkyvästi puheissaan, Kiinan kimppuun. Kun vaikuttava pointti, niin tätä on hyvä liittää muihin vastaaviin. Venäjällä oli joskus ongelmaa siitä, kun Suomen joista virtasi ylimääräistä vettä. Nää on aika hassuja, olettaen, että juoksutus on normaali osa luonnonkulkua, jolta Venäjäää tulisi varjella.

Vielä ongelmallisemmaksi Trumppiin liittyvän riskin tekee se, että hölmöltä (ja vaaralliselta) näyttävä tosiaan tiivistetään häneen. Ratkaisuja ei tavallaan tarvitse puntaroida enempää, joten taustalle mahtuu kaikkea sellaista, mitä ei aleta kovin suoranaisesti liittää ratkaisuihin.

Todellisuudenpesussa on monenlaisia keinoja. Tyypillinen tosiaan rajapinnat, ja niiden ilmeneminen. Trump on passeli. Täällä rulettaa aika toisenlaiset painotekijät, ihmisten mieltenkäännössä. Koronaan liittyy samanlaista myyntityötä.