Uutiset:

Ilmoitustaulu mahdollisten ongelmien varalta (wikimedia.org / Etherpad)

Sähköpostia ylläpidolle: kantapaikanherra (at) gmail.com

Main Menu

Koronatyökaluja, tutkimusta ja statistiikkaa

Aloittaja Aave, maaliskuu 29, 2020, 14:12:54

« edellinen - seuraava »

0 Jäsenet ja 1 Vieras katselee tätä aihetta.

Toope

Nyt Delta, ovat kirjain D:ssä jo. Aakkosia riittää.
https://www.iltalehti.fi/ulkomaat/a/0e195bad-3202-4446-888a-65eec1857cdd
Vaikka olen perinteisesti rokotepositiivinen, olen itseni ja lapseni rokotuttanut (ne oikeat rokotteet!), en taida enää, jos joka vitun flunssaan pitää joku piikki ottaa.
Ehkä ei enää...

Norma Bates

Lainaus käyttäjältä: Toope - heinäkuu 02, 2021, 00:22:29
Nyt Delta, ovat kirjain D:ssä jo. Aakkosia riittää.
https://www.iltalehti.fi/ulkomaat/a/0e195bad-3202-4446-888a-65eec1857cdd
Vaikka olen perinteisesti rokotepositiivinen, olen itseni ja lapseni rokotuttanut (ne oikeat rokotteet!), en taida enää, jos joka vitun flunssaan pitää joku piikki ottaa.
Ehkä ei enää...

Mikä tekee rokotteesta "oikean"? Oliko isorokkorokote oikea silloin kun sitä kokeiltiin ensimmäisiä kertoja eikä tiedetty lainkaan että miten käy? Ei ollut edes eläinkokeita siinä välissä, kun muistaakseni tyyppi vain tökkäsi lehmärokkoa johonkin nuoreen poikaan. Koronarokotteenkaan kohdalla ei ihmiseen pistetä itseään koronavirusta.

Flunssaksi vähättelyn soisi jo loppuvan jokaiselta jolla on elin nimeltä aivot. Korona on semmoinen jänskä juttu että se on hengitysteitse tarttuva virus joka aiheuttaa verisuonitaudin.

Karikko

Lainaus käyttäjältä: Norma Bates - heinäkuu 02, 2021, 09:15:44
Lainaus käyttäjältä: Toope - heinäkuu 02, 2021, 00:22:29
Nyt Delta, ovat kirjain D:ssä jo. Aakkosia riittää.
https://www.iltalehti.fi/ulkomaat/a/0e195bad-3202-4446-888a-65eec1857cdd
Vaikka olen perinteisesti rokotepositiivinen, olen itseni ja lapseni rokotuttanut (ne oikeat rokotteet!), en taida enää, jos joka vitun flunssaan pitää joku piikki ottaa.
Ehkä ei enää...

Mikä tekee rokotteesta "oikean"? Oliko isorokkorokote oikea silloin kun sitä kokeiltiin ensimmäisiä kertoja eikä tiedetty lainkaan että miten käy? Ei ollut edes eläinkokeita siinä välissä, kun muistaakseni tyyppi vain tökkäsi lehmärokkoa johonkin nuoreen poikaan. Koronarokotteenkaan kohdalla ei ihmiseen pistetä itseään koronavirusta.

Flunssaksi vähättelyn soisi jo loppuvan jokaiselta jolla on elin nimeltä aivot. Korona on semmoinen jänskä juttu että se on hengitysteitse tarttuva virus joka aiheuttaa verisuonitaudin.

No veren välityksellä yleensä molekyylit osaavat kommunikoida keskenään ja "huolehtia elimistön tarpeista.
Virus ottaa solujen energiatuotannon omaan käyttöönsä ja tuottaa kopioitaan jotka leviävät ympäristöön ihmiseen ja ulkopuolelle muidenkin saataville.

Siltä suojautumiseen immuunipuolustuksella on sitten keinonsa tuottaa vasta-aineita ja muita reaktioita viruksen tuhoamiseksi.

Solujen proteiinisynteesissä on  molekyylejä varmaan noin 20 000 erilaista joiden yhteistoiminta mahdollistaa sen vuorovaikutuksen jota synteesiin tarvitaan.  "Väärin toimivat molekyylit tuottavat häiriöitä, muuten vakaaseen systeemiin.

Norma Bates

https://yle.fi/uutiset/3-12004305

Tuoreen yhdysvaltalais-australialaisen tutkimuksen mukaan COVID-19:n aiheuttaja SARS-CoV-2 ei silti ole ensimmäinen koronavirus, joka on syypää laajaan ja vakavaan epidemiaan.

Sellainen puhkesi Itä-Aasiassa runsaat 20 000 vuotta sitten, ja sen jäljet näkyvät yhä joidenkin ihmispopulaatioiden perimässä – samalla tavoin kuin ympäristöolosuhteet tallentuvat puiden vuosirenkaisiin, vertaa Queenslandin teknillisen yliopiston(siirryt toiseen palveluun) synteettisen biologian professori Kirill Alexandrov.

...

Mutaatioiden perusteella he laskivat, että jokin koronavirus oli alkanut sairastuttaa itäaasialaisia noin 23 000 vuotta sitten. COVID-19:n kaltainen roihahdus se ei ollut eikä silloisessa maailmassa voinutkaan olla, vaan viruksen levittäytyminen vei satoja vuosia.

Muista maanosista ei löytynyt merkkejä tästä muinaiskoronasta, mutta Itä-Aasiassa se levisi nykyisten Japanin, Kiinan, Mongolian, Taiwanin, Vietnamin ja molempien Koreoiden alueelle.

...

Tulevien koronatautien nujertamisen kannalta havainnot 42 geenin vaikutuksesta ovat hyvin kiinnostavia, tutkijat sanovat. Souilmin mukaan tulokset osoittavat, missä ovat "ne molekyylinappulat, joita kääntämällä säädetään immuunivastetta".

– Menneisyydessä tapahtuneilla asioilla on taipumus toistua, varoittaa puolestaan Arizonan yliopiston ekologian ja evoluution apulaisprofessori David Enard, mutta näkee siinä samalla mahdollisuuden.

Ehkä tutkimus on alku sille, että menneisyyden genomimuutoksia selvittämällä pystytään luomaan hälytysjärjestelmä, joka varoittaa hyvissä ajoin uusien pandemioiden uhkasta, hän sanoo.

Norma Bates

https://www.hs.fi/tiede/art-2000008391522.html?fbclid=IwAR24sF_7H0inZl5YdIsWe25zCu2tK3549rZpr0INo64_wJh2cqlID7_S81s

Tutkijat selvittivät, miksi delta­variantti tarttuu niin tehokkaasti: yhden amino­hapon mutaatio lisää tartuttavuutta monin­kertaisesti

...

Piikkiproteiini lienee monelle tässä vaiheessa tuttu käsite. Esimerkiksi Pfizerin ja Modernan mrna-rokotteet perustuvat siihen, että elimistö oppisi tunnistamaan tämän piikkiproteiinin ja näin suojautumaan virukselta.

Mutta viruksen rakenteessa on myös muita proteiineja. Science-lehdessä julkaistussa tutkimuksessa on löydetty koronaviruksen deltamuunnoksesta toinen tärkeä mutaatio, joka lisää olennaisesti viruksen tarttuvuutta.

Tämä mutaatio on viruksen nukleokapsidissa eli tavallaan viruksen kuoressa, jonka sisällä on viruksen tarttuva perimäaines. Mutaation olemassaolo on tiedetty, mutta nyt sen toiminnasta päästiin tarkemmin selville.

Kun piikkiproteiinin otollinen muoto auttaa virusta ensiksi pääsemään sisään soluun, niin tämä toinen mutaatio auttaa virusta levittämään perimäainestaan tehokkaammin solun sisälle. Tuloksena tartunnan saanut solu tuottaa uusia viruksia entistä enemmän.

UUDEN havainnon mahdollisti nokkela keksintö, jonka Nobel-voittaja Jennifer Doudna kehitti kollegoineen.


Linkissä lisää.


MrKAT

#51
Miksi epidemiat aaltoilee, miksi siinä on aaltoja ja tyynejä hetkiä?
(Korona)epidemiaa on mallitettu vanhastaan SIR-mallilla joka esim. liioittelee tulevaa aaltoa,
nyt tutkijat esittelivät paljon osuvammin ennustavamman SSA-mallin. Käsittääkseni se mm. ottaa sosiaalisten suhteiden satunnaisuudet paljon paremmin huomioon.

Nigel Goldenfeld @NigelGoldenfeld
Why do epidemics have waves and plateaus?  The latest publication from the Illinois COVID modeling group shows that heterogeneous social activity as a baseline, plus mean-reverting variations from baseline leads to waves and plateaus similar to observed.

- https://twitter.com/NigelGoldenfeld/status/1470847540782198785

New model accurately describes COVID-19 waves and plateaus: adding random nature of social activity to traditional model, graphs match waves and plateaus of regional U.S. data

Figure 1 in the published paper depicts a schematic illustration of the Stochastic Social Activity model in which each individual changes their social activity over time. People with low social activity (depicted as socially isolated figures at home) occasionally increase their level of activity (depicted as at a party). The average activity in the population remains the same over time, but individuals constantly change their activity levels from low to high (arrows pointing up) and back (arrows pointing down). Individuals are colored according to their state: susceptible = green, infected = red, and recovered/removed = blue. The epidemic is fueled by constant replenishment of the susceptible population when individuals move from the low-activity state to high-activity settings. Virus transmission occurs predominantly between individuals having high current activity levels.  Credit: A. V. Tkachenko, et al., eLife, December 14, 2021
- https://physics.illinois.edu/news/43769

Malli(n tulos) heittää (tartunta)laumasuojalle vesilintua, perint. mallilla piti syntyä laumasuoja helposti. (Tulkitsen miten käsitin: ) Mutta ihmisten sos. suhteet on niin satunnaiset ja vaihtelevat, että aina löytyy uutta hedelmällistä neitseellistä taskua ja paikallisaalto puhkeaa kun ihmisiä menee juhlimaan ja tuo tautia kotiinsa vielä eristetymmille pikkutaskuille (perheelleen/suvulleen/kylälleen/pikkukaupungilleen). Näin tauti pysyy hengissä vaikka perinteisessä mallissa sen piti tuhota itsensä kun kaikki sai tartunnan. Eipä saaneet.

Aiempi tutkimuksensa: https://www.pnas.org/content/118/17/e2015972118
johon mallinsa perustuu.

Goldenfeld (yksi tutkijoista) selventää ko. twitter-ketjussansa:
The randomness and dynamic variability of individual social interactions, as well as individual differences in the size of social networks produces waves or plateaus even if individuals do not change their social behavior based on knowledge of current infection rates.
---
The model assumes infection rates are highest when social activity is highest, and we solve an age of infection model coupled to the stochastic social activity.  Helpfully, the model maps into the Cox-Ingersoll-Ross model of financial interest rates!
---
To falsify the model, we compare with observational data from four major regions of the USA:  Northeast, Midwest, South, and West during mid-July 2020 to mid-February 2021 when there were no seasonal variations, vaccination, government or self-imposed mitigations and NPIs.

(Punainen on perinteisen SIR-mallin ennuste ja sininen uuden SSA-mallin ennuste, musta on toteutunut USA:n Keskilännessä).

---
Main result is that the usual SIR type models predict an epidemic peak that is too high and too late compared to the stochastic social activity model.

We started this research in spring 2020 because we were puzzled by why many predictions of epidemic severity were too high.

...
Missä perussuomalainen törttöilemässä, siellä Jokisipilä puolustelemassa.
                    - Vanha turkulainen sananlasku (by Antti Gronow)

Karikko


^

Sulkutoimet ovat tätä viruksen esiintymistä vähentäneet (hidastaneet) ja aaltoilu on paljolti sen syytä- tässä tavassa, mutta sitten tulee niitä uusia variantteja sekaan sotkemaan ja saadaan aaltoilun yhteisvaikutusta myös lisäksi ja epidemian jatkuvuuskin on taattu.

No eihän se kertarysäyskään mikään kovin toivottava asia varmaan ole.  Aaltoilu jatkunee vielä kauan tällä menolla, ei näytä mitään pelastusta olevan tulossa..

Norma Bates

https://www.hs.fi/kotimaa/art-2000008498172.html?share=8b53312a6b35ad0710675f7bf7fd5e6d

"SUOMESSA 11-vuotiailla on todettu viime viikkoina jopa kaksinkertainen määrä koronavirus­tartuntoja 12-vuotiaisiin verrattuna, selviää Helsinki Graduate School of Economicsin (GSE) ja Valtion taloudellisen tutkimus­keskuksen perustaman tutkimusryhmän Tilannehuoneen tilastoista.

GSE on Aalto-yliopiston, Hankenin ja Helsingin yliopiston yhteinen yksikkö.

Tilannehuone selvitti tartuntatauti­tiedoista, että 11- ja 12-vuotiaiden lasten koronatartunnat kehittyivät pitkälti samalla tavalla aina vuoden 2021 syksyyn asti. Elokuussa Suomessa aloitettiin 12–15-vuotiaiden lasten rokotukset."

Norma Bates

https://www.brown.edu/news/2021-12-14/bubbler

On kehitetty laite joka testaa koronaa puhalluksesta. Pystyy erottelemaan onko kyseessä juuri nyt meneillään oleva tartunta.

Sain tiedon Tieteen Kuvalehden mainoksesta, mutta kuten aina, artikkeli on maksumuurin takana. Googlettamalla löysin vain englanninkielistä materiaalia tältä kuluvalta kuulta.

Karikko

Lainaus käyttäjältä: Norma Bates - joulukuu 26, 2021, 12:07:44
https://www.brown.edu/news/2021-12-14/bubbler

On kehitetty laite joka testaa koronaa puhalluksesta. Pystyy erottelemaan onko kyseessä juuri nyt meneillään oleva tartunta.

Sain tiedon Tieteen Kuvalehden mainoksesta, mutta kuten aina, artikkeli on maksumuurin takana. Googlettamalla löysin vain englanninkielistä materiaalia tältä kuluvalta kuulta.

Maksanee melko paljon, jos toimii. Olisi kaiketi melko kiva juttu, jos laite tekisi koko homman ilman laboration määritelmää.

Koiria mainostettiin aluksi hyvinä viruksen tunnistajina- ehkä siis ne vainusivat niitä muutoksia joita se virus aiheutti ihmisen "tuoksuominaisuuksissa.

Ehkä se konekin saadaan oppimaan samantapainen juttu.

Varmaan ostajia riittää, jos sellainen vekotin on myyntivalmis..

Norma Bates

Koronatartunnan saaneiden elimistössä autoimmuunireaktio

Tutkijat uskovat tunnistaneensa yhden niin sanotun pitkän koronataudin aiheuttavista mekanismeista elimistössä. Yhdysvaltalaisen Cedars-Sinain lääketieteellisen sairaalan tutkimuksessa havaittiin, että Covid-19-taudin synnyttämä immuunivaste voi kestää pitkään taudin väistymisen jälkeen ja aiheuttaa tuhoja elimistössä.

Uutta tutkimuksessa on havainto siitä, että ylikierroksilla käyvä immuunijärjestelmä liitettiin myös lievän tai oireettoman koronataudin sairastaneisiin potilaisiin. Normaalien koronaviruksen vasta-aineiden lisäksi potilaiden elimistö voi alkaa tuottaa niin sanottuja autovasta-aineita, jotka voivat ajan myötä hyökätä elimistön omia elimiä ja kudoksia vastaan, tutkijat kirjoittavat tiedotteessaan.

Kun tutkijat mittasivat vasta-aineiden määrää koronataudin sairastaneilla henkilöillä, he havaitsivat näytteissä "laajan skaalan erilaisia autovasta-aineita" jopa kuusi kuukautta taudin sairastamisen jälkeen. Ennen tätä tutkimusta autovasta-aineiden tuottaminen on yhdistetty vain koronataudin vaikeampiin muotoihin.

"LÖYTÖMME AUTTAVAT ymmärtämään, mikä tekee Covid-19:stä erityisen ainutlaatuisen taudin", sanoo tutkimuksen toinen pääkirjoittaja Justyna Fert-Bober sairaalan tiedotteessa.

"Immuunijärjestelmän epävakauteen viittaavat havaintomme voivat luoda pohjan selitykselle, miksi ihmiset kehittävät monia erilaisia oireita oireyhtymässä, jota kutsumme nyt pitkäksi koronataudiksi."

Tutkimuksessa analysoitiin verinäytteitä 177 koronataudin aiemmin sairastaneelta ihmiseltä. Heidän verinäytteitään verrattiin ennen koronapandemiaa kerättyihin verrokkiryhmän verinäytteisiin. Kaikkien koronataudin sairastaneiden verinäytteistä havaittiin kohonnut autovasta-aineiden määrä, ja osa tunnistetuista autovasta-aineista ovat samoja, jotka on yhdistetty autoimmuunitauteihin, kuten SLE:hen ja reumatismiin.

"Löysimme merkkejä autovasta-aineista, jotka yhdistetään tavallisimmin kroonisiin tulehduksiin ja vammoihin tietyissä kehon osissa, kuten nivelissä, ihossa ja hermostossa", jatkaa tutkijaryhmän jäsen Susan Cheng.

OSA KORONATAUDIN sairastaneiden verinäytteistä löydetyistä autovasta-aineista on liitetty autoimmuunitauteihin, jotka ovat yleisempiä naispuolisilla henkilöillä. Tutkimuksessa autovasta-aineiden määrä oli kuitenkin korkeampi miehillä.

Fert-Bober sanoo havainnon olevan osaltaan paradoksaalinen, mutta toisaalta ymmärrettävä, sillä miehillä on korkeampi riski sairastua koronataudin vakavaan muotoon.

Seuraavaksi tutkijat haluavat tarkastella autovasta-aineiden määrän ja pitkän koronataudin yhteyttä tarkemmin. Lisäksi olisi oleellista selvittää, pitävätkö tutkimuksen havainnot paikkansa myös niin sanottujen läpäisytartuntojen kohdalla. Kyseisen tutkimuksen aineisto oli koostettu ennen koronarokotteiden käyttöönottoa.

Tutkimusraportti on julkaistu Journal of Translational Medicine -tiedelehdessä. Lisää aiheesta tutkimustiedotteessa.

kertsi

Tyrkyllä merkkejä kopioitavaksi: ❤️😀🙂🐵🐒🦄🕊️☘️🌿😍🤪🤕🥴😵 👍✌️

Norma Bates

Suolistobakteerit saattavat selittää Etelä-Korean, Japanin ja Suomen vähäisemmän koronakuolleisuuden.

https://experience.arcgis.com/experience/d40b2aaf08be4b9c8ec38de30b714f26?fbclid=IwAR32Jly-aXfpt9JvsMNSIu2i24Dvs1NEbKAXV-dEElRz-AIrW-1IpogPU_o

"I'm not saying that intestinal bacteria alone can cure COVID-19," said the study's lead researcher, Masaaki Hirayama, an associate professor at the university's Graduate School of Medicine. "The purpose of this study was to see if we could make a breakthrough in treatment if we could find at least one thing related to factor X."

Hirayama said that collinsella transforms the gut's bile acids into ursodeoxycholic acid, which has been known to suppress the binding of the coronavirus to its receptor and inhibit the potentially deadly immune response called a cytokine storm.

Aave

Rokotteiden tehoja koskevassa vertaistutkimuksessa Modernan rokote on osoittautunut ehkä aavistuksen tehokkaammaksi, kuin Pfizerin. Kumpikin on silti ollut oikein hyviä siinä, mihin ne on suuuniteltu:

COVID-19: Moderna vaccine may reduce infection risk more than Pfizer (medicalnewstoday.com).

Jenkkitutkimuksessa on käytetty 89 miljoonan ihmisen terveystietoja, eli otoskoko on melkoinen.

"The researchers found that in November 2021, there were 2.8 breakthrough cases of COVID-19 in people fully vaccinated with the Pfizer vaccine per 1,000 people. They included breakthrough cases if the people had not received the booster vaccination or had not had a prior recorded infection with SARS-CoV-2.

For the Moderna vaccine, the monthly figure was significantly lower, at 1.6 breakthrough cases per 1,000 people who received these shots.

The risk of hospitalization in the 60 days after infection was also lower for people fully vaccinated with the Moderna vaccine: 12.7% for Moderna versus 13.3% for Pfizer.

The researchers did not see a significant difference in mortality rates between the two vaccine groups".


"...Did they get you to trade your heroes for ghosts?" - David Gilmour
Stasik - Lullaby For The
Enemy